Το Protein είναι ένα θέμα για το superkaramba με χρήση του οποίου γίνετε δυνατή η παρακολούθηση των στατιστικών του folding@home.
Τι είναι το superkaramba; Τι είναι το folding@home;

1. Κατεβάζουμε στον υπολογιστή μας το αρχείο Protein-x.xx.tar.gz και το αποθηκεύουμε σε ένα κατάλογο της επιλογής μας
2. Αποσυμπιέζουμε το αρχείο Protein-x.xx.tar.gz και εξάγεται ο κατάλογος Protein-x.xx
3. Μεταφέρουμε τον αποσυμπιεσμένο κατάλογο όπου μας βολεύει
4. Εκτελούμε το αρχείο Protein-x.xx/Protein.theme με το superkaramba
5. Δεξί «κλικ» στο Protein ~> Ρύθμιση θέματος ~> Settings
6. Στο παράθυρο που θα εμφανιστεί θα πιέσουμε το κουμπί «...» στο ύψος του «F@H directory:»
7. Επιλέγουμε τον κατάλογο του FAH client και απαντάμε καταφατικά στα δύο ανοιχτά παράθυρα
8. Το Protein θα επαναφορτωθεί αυτόματα ;)

ΠεριγραφήΤα θέματα του Protein αποτελούνται από ένα κατάλογο που περιέχει όλα τα απαραίτητα αρχεία. Στο μενού επιλογής θεμάτων, τα ονόματα προέρχονται από την ονομασία του καταλόγου του θέματος. Στον κατάλογο των θεμάτων πρέπει να υπάρχει ένα σωστό σε σύνταξη αρχείο που καθορίζει την εμφάνιση του Protein με όνομα config.xml .Ο τρόπος που επεμβαίνουμε στο config.xml αναλύεται παρακάτω. O κατάλογος Path_To_Protein_Theme/themes/examples/ περιέχει παραδείγματα όλων των τύπων που υποστηρίζονται από το Protein και τα οποία προορίζονται για πρότυπα δημιουργίας νέων, των δικών σας θεμάτων.

Τύποι θεμάτων

1. Δεν αντιστοιχεί σε κανένα τύπο μέχρι στιγμής και υπάρχει για μελλοντική χρήση.
2. Το θέμα αποτελείτε από τρεις σελίδες. Η πρώτη περιέχει τα στατιστικά της πρωτεΐνη, η δεύτερη τα στατιστικά του χρήστη και η τρίτη τα στατιστικά της ομάδας του χρήστη. Ακόμα αυτός ο τύπος έχει ένα τίτλο και μία εικόνα. Ο τίτλος παρέχει ένδειξη για το ποια σελίδα είναι φανερή και είναι θερμή περιοχή παρέχοντας έτσι τη δυνατότητα της άμεσης ανανέωσης των στατιστικών. Η εικόνα είναι θερμή περιοχή και αλλάζει σειριακά τις σελίδες.
3. Το θέμα δεν έχει σελίδες και εμφανίζει όλα τα στατιστικά μαζί.

ΔιαδικασίαΓια την δημιουργία νέου θέματος η διαδικασία είναι η ακόλουθη: Για παράδειγμα αντιγράφουμε τον κατάλογο Path_To_Protein_Theme/themes/1.1.1/Full.v1.1.1.StyleC στο Path_To_Protein_Theme/themes/ ,αλλάζουμε το όνομα Full.v1.1.1.StyleC/ με ένα της αρέσκειάς μας, επεξεργαζόμαστε το αρχείο config.xml, κάνουμε αποθήκευση και τέλος εκτελούμε το Protein ή το κλείνουμε και το ξανανοίγουμε αν εκτελείτε ήδη. Πιέζουμε το δεξί κουμπί του ποντικιού όταν ο κέρσορας βρίσκετε στο Protein ~> Ρύθμιση Θέματος ~> επιλέγουμε το θέμα μας και βλέπουμε το αποτέλεσμα!

<Author></Author>
Το tag Author εσωκλείει γενικές πληροφορίες για τον δημιουργό. Τα περιεχόμενα του δεν επηρεάζουν την εμφάνιση του θέματος αλλά είναι απαραίτητη η ύπαρξη τους. Αν δεν θέλετε να συμπληρώσετε τα στοιχεία σας θα πρέπει τουλάχιστον να υπάρχει η τιμή None. Πιο συγκεκριμένα αποτελείτε από: <author></author> Όνομα δημιουργού του θέματος
<author_email></author_email> Διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου του δημιουργού του θέματος
<homepage></homepage> Διεύθυνση δικτυακού χώρου του δημιουργού του θέματος
<version></version> Έκδοση του θέματος
<license></license> Άδειας χρήσης

<Mode id='Theme'><Mode>
Το tag Mode με όνομα Theme περιέχει γενικές πληροφορίες για την εμφάνιση του θέματος και αποτελείτε από τα επιμέρους tags:
<version></version> Η έκδοση του διαχειριστή θεμάτων που θα χρησιμοποιηθεί. Οι τιμές μπορεί να είναι “1” ή “1.1” ή “1.1.1” Ο διαχειριστής θεμάτων στην έκδοση 1 είναι πειραματικός, ασταθής, δεν υποστηρίζεται και υπάρχει για λόγους συμβατότητας· ως εκ τούτου δεν συνιστάτε η χρήση του.
<w></w> Το πλάτος του θέματος σε εικονοστοιχεία.v <h></h> Το ύψος του θέματος σε εικονοστοιχεία.
<i></i> Η συχνότητα ενημέρωσης του θέματος και των στατιστικών σε χιλιοστά(!) του δευτερολέπτου.
<f></f> Το όνομα της γραμματοσειράς.
<s></s> Το μέγεθος της γραμματοσειράς
<c></c> Το χρώμα της γραμματοσειράς. Η τελική απόχρωση απαρτίζεται από τα χρώματα κόκκινο, πράσινο, μπλε με τιμές από 0 – 255 και χωρισμένες με το χαρακτήρα ,
<sw></sw> Η απόσταση που χωρίζει τα γράμματα από την σκιά τους.

<Mode id='Menu'><Mode>
Το tag Mode με όνομα Menu είναι υπεύθυνο για την εμφάνιση του μενού.
<Item id="MenuStyle"></Item> Ο τύπος του θέματος. Οι τιμές που μπορεί να πάρει είναι: a, b, c.
<Item id='Image'> Περιέχει πληροφορίες για την θερμή εικόνα του θέματος με τύπο b.
<x></x> Η θέση της εικόνας στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y></y> Η θέση της εικόνας στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<v></v> Το όνομα του αρχείου της εικόνας.
</Item>
<Item id='Title'> Περιέχει πληροφορίες για τον τίτλο του θέματος με τύπο b.
<x></x> Η θέση του τίτλου στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y></y> Η θέση του τίτλου στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<w></w> Το πλάτος του κειμένου του τίτλου
<h></h> Το ύψος του κειμένου του τίτλου
<v1></v1> Η συμβολοσειρά που θα εμφανίζεται στην σελίδα με τα στατιστικά της πρωτεΐνης.
<v2></v2> Η συμβολοσειρά που θα εμφανίζεται στην σελίδα με τα στατιστικά του χρήστη.
<v3></v3> Η συμβολοσειρά που θα εμφανίζεται στην σελίδα με τα στατιστικά της ομάδας.
<s></s> Το μέγεθος της γραμματοσειράς του τίτλου.
<c></c> Το χρώμα της γραμματοσειράς.
<f></f> Το όνομα της γραμματοσειράς.
<sw></sw> Η απόσταση που χωρίζει τα γράμματα από την σκιά τους.v </Item>
<Item id='Background'> Περιέχει πληροφορίες για το φόντο του θέματος.
<x>0</x> Η θέση του φόντου στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y>0</y> Η θέση του φόντου στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<v></v> Το όνομα του αρχείου της εικόνας φόντου.
</Item>

<Mode id='Progress'> Περιέχει πληροφορίες για την εμφάνιση των στατιστικών της πρωτεΐνης.
<Mode id='Self'> Περιέχει πληροφορίες για την εμφάνιση των στατιστικών του χρήστη.
<Mode id='Team'> Περιέχει πληροφορίες για την εμφάνιση των στατιστικών της ομάδας του χρήστη.
Κατά κύριο λόγο τα τρία τελευταία Modes περιέχουν, όσο αναφορά την υπόσταση των αντικειμένων, ετικέτες κειμένου και για αυτό η συμπεριφορά τους θα μελετηθεί μία φορά αφού είναι ίδια.
<Item id=''> Το tag Item με μοναδικό όνομα που προσδιορίζει σε ποιο αντικείμενο μεταφέρει τις ιδιότητες και για αυτό το λόγο δεν θα πρέπει να αλλαχθεί.
<x></x> Η θέση της ετικέτας κειμένου στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y></y> Η θέση της ετικέτας κειμένου στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<w></w> Το πλάτος της ετικέτας κειμένου.
<h></h> Το ύψος της ετικέτας κειμένου.
<v></v> Η συμβολοσειρά της ετικέτας κειμένου.
<s></s> Το μέγεθος της γραμματοσειράς.
<c></c> Το χρώμα της γραμματοσειράς.
<f></f> Το όνομα της γραμματοσειράς.
<sw></sw> Η απόσταση που χωρίζει τα γράμματα από την σκιά τους.
<align></align> Η διάταξη του κειμένου. Οι τιμές που δέχεται είναι LEFT ή CENTER ή RIGHT. Αυτό το tag υποστηρίζεται από τον διαχειριστή θεμάτων έκδοσης 1.1.1 και μεταγενέστερης.
</Item>

Τέλος εκτός από ετικέτες κειμένου υπάρχει και μία μπάρα προόδου.
<Item id='BProgress'> Η σταθερή εικόνα που θα χρησιμοποιηθεί.
<x></x> Η θέση της εικόνας στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y></y> Η θέση της εικόνας στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<v></v> Το όνομα του αρχείου της εικόνας.
</Item>
<Item id='LProgress'> Η μεταβαλλόμενη εικόνα ανάλογα με το ποσοστό ολοκλήρωσης της εργασίας που θα χρησιμοποιηθεί.
<x></x> Η θέση της εικόνας στον άξονα χ των εικονοστοιχείων.
<y></y> Η θέση της εικόνας στον άξονα ψ των εικονοστοιχείων.
<w></w> Το πλάτος της εικόνας.
<h></h> Το ύψος της εικόνας.
<v></v> Το όνομα του αρχείου της εικόνας.
</Item>